[bez zařazení] Tvar hybernačních schránek je zcela jiný než na konci předchozího dílu ( Ve vetřelcích byly zkosené, ze dvou částí a zde jsou rovné, jednodílné ). Navíc se uzavírají úplně jinak než ve vetřelcích - jakoby napřeskáčku, jednou zdola, jednou shora - ve trojce všechny zhora.

[posloupnost] Během pitvy Newt skvrna na Clemensově plášti mění svoji velikost i polohu.

[audio-chyby] Directors cut: Ve scéně na konci filmu, když Aaron zaútočí na "lidského" Bishopa, tak vykřikne "It was a mistake. There was no need for any of it." Při pozornějším sledováni si můžete všimnout, že se jeho rty hýbou pomalu, jako kdyby klidně mluvil, nikoliv křičel. Zřejmě je to důsledek změn scénáře(kterých v tomto filmu bylo hodně) a proto bylo potřeba, aby říkal jiný text.

[audio-chyby] Ke konci filmu vojáci ze společnosti zastřelí Aarona pulzní puškou dobře známou z předešlého dílu. Při pozornějším poslechu si můžete všimnout, že zvuk střelby pulzní pušky je úplně jiný, než ve Vetřelcích.

[bez zařazení] Na začátku filmu je dobře vidět že skla hybernačních schránek jsou jsou značně poškozená ( jednu poškodil a jednu zničil facehuger když se chtěl přisát na Newt a Ripleovou, zbylé praskly při havárii modulu ) ale když si dělá Ripleová rengen tak je minimálně jedno sklo NEPOŠKOZENÉ, a úplně na konci filmu když vidíme poslední záběr do vnitřku modulu jsou již hned dvě přední schránky taktéž nepoškozené a modul je najednou poměrně čistý.

[posloupnost] Na začiaku filmu, keď väzni vytiahli záchranný modul, ho následne otvoria. Pri jednom zábere vidno modul Rypleyovej, ktorý má rozbité sklo a následne aj Rypleyovú, ktorá tam pokojne leží celá čistá a bez poraneného oka. V ďalšom zábere keď ju idú ošetrovať, položia ju na operačný stôl. T tomto zábere je celá špinavá. Nemohla sa sama tak rýchlo zašpiniť, pretože nebola pri vedomí. Taktiež v tom istom zábere nie je vidno, aby mala poranené oko. Zase keď sa Rypleyová zobudí, jej ľavé oko je už značne poškodené.

[bez zařazení] Při hyberspánku jsou oči zavřené, a Newt se utopila ve spánku, ale v márnici má oči otevřené (Ripleyová jí je zavírá).

[bez zařazení] Nejsem si zcela jistý, je-li to chyba, ale uvažte, že vetřelec, který se na začátku filmu při pohřbu Newt vylíhne z toho psa, je v podstatě stejně velký jako ten pes sám. Musel by ho zevnitř teoreticky vyplňovat celého a to potom nevím, jak by ten pes vůbec mohl žít. Vezměme též v úvahu velikost vetřelce, který se vydere z hrudi Ripleyové.