[posloupnost] Když je Christina ve svém pokoji a poté ji Fantóm bere do podzemí, nemá Christina žádné oční stíny. Dole v podzemí už má ale stíny šedo-černé.

[chyby v animaci/efektech] Když Raul spadne do díry s vodou při záchráně Christine ke konci filmu, tak nad ním začne klesat mříž. V jednom záběru jdou bubliny směrem dolů a ne nahoru, jakoby tu byl použitý záběr z chvíle, kdy mříž už stoupá zase nahoru, jen přehraný pozpátku.

[posloupnost] Na konci filmu, když vystupuje hlavní hrdinka z vody, tak má mokré šaty. V dalším záběru, už mokré nejsou.

[posloupnost] Když Christine omdlí při spatření figuríny se svojí podobou a Fantom ji nese v náručí, má na sobě světlé punčochy. Když se ale po čase probere a jde z lůžka, je úplně bosa.

[posloupnost] Když jde Christine k zrcadlu a dále chodbou s fantomem, má seplé horní vlasy a má jemné růžové oční stíny. Působí nevinně. Když pak jede na koni a loďkou do katakomb, její vlasy jsou už úplně rozpuštěné a její víčka jsou svůdně nalíčena tmavě hnědou barvou.

[bez zařazení] Při písní "Music of the night" se v jednom záběru vlevo dole objeví kamera.

[posloupnost] Když se lustr řítí do hlediště, tak řetěz ničí strop a suť padá do hlediště. Při jednom záběru je padající suť vidět, ale v následujících nikoliv. Je vidět pouze padající lustr.

[posloupnost] Fantómovi opery se v průběhu filmu mění rozsah znetvoření, (podle toho jakou masku má na sobě) a také barva vlasů, z černé na světle hnědou.

Má paruku.

[posloupnost] Ve scéně, kdy plují v kanálech na lodi po vstupu do jeskyně, vyjíždí z vody již zapálene svíčky.

[posloupnost] Když Christine Fantomovi poprvé sundá masku, jeho vlasy zůstávají černé, ale když ji sundá na konci, má je světle hnědé.

[nic] Když poprvé Christine odchází zrcadlem do podzemí, Fantom ji v pokoji zamkne a klíč si vezme. Jak je možné, že ji později hledá Meg a jde do pokoje normálně odemčenými dveřmi?

Meg má klíče, které jsou dost jasně vidět.

[posloupnost] Všimněte si toho nádherného střihu, když Christine sundává při hře Don Juan Fantomovi masku... Tomu v momentě zesvětlá barva vlasů, najednou je rozcuchaný. A jizva se mu rozleze až nad ucho.

Má paruku.

[posloupnost] Když Christine sundá Fantomovi poprvé masku tak se chytne za tvář, aby neviděla jeho zhyzděný obličej. Když přistoupí k zrcadlu dá ruku dolů. Potom se zase chytí za tvář, ale za tu druhou na které má být normální.

[bez zařazení] Na začátku filmu vypadá vikomt de Changy o několik let starší než Madame Giry. Ale když se vracíme zpátky do minulosti, tak to vypadá, že Madame Giry je starší než vikomt a má dokonce dceru ve věku vikomta.

[bez zařazení] Když jde Raul pro svou milovanou do podzemí, spadne do propadla a rovnou rovně do vody. Najednou je nad ním ale klec, která se ho snaží utopit. Jak teda mohl propadnout, kdyby tam ta mříž byla?

[posloupnost] Při písni Masquerade, když spolu tančí Raoul a Christina, Má Raoul rozepnuté sako a z půlku sundané. Teprve až když se objeví fantom a on odejde pro meč, když se vrátí má ho "upravené".

[viditelné vybavení/štáb] Ve scéně, kdy fantom veze Christine na loďce do podzemí a z vody vystupují svíčky, je krásně vidět, že svíčky vystupují až za vodou ze sucha...

[logické chyby] Jak to, že fantom umí psát (dopis pro vedoucí opery), když celý život žil jako "Ďáblovo dítě" s kočovnými cikány a poté bydlel v podzemí? Kdo ho učil psát?

[faktické chyby] Na konci, když Megg vejde do jeskyně přes jezero, je mokrá až po zadek. V dalším záběru, kdy nachází masku je suchá...