[bez zařazení] Když se Padmé a jeden klon po vypadnutí z lodi proberou, Padmé říká, že musí vzít co nejvíc vojáků a rychle letět do toho hangáru. Přitom o žádném hangáru neví a ani nemohla vidět, jak tam Dooku a poté i Obi-Wan a Anakin letí.

[bez zařazení] Anakin a Padmé jsou na Tatooine. Příjdou na loď, protože mají zprávu od Obiwana. Obiwan říká, aby tu zprávu přeposlali, Padmé proto zmáčkne na palubní desce nějaké tlačítko a tu zprávu tak přepošle. Když následně Padmé chce Anakinovi ukázat, kde leží Geonosis, zmáčkne TO SAMÉ tlačítko. Že by se jedním tlačítkem ovládalo tolik věcí?

[bez zařazení] Když Obi Van bojuje na planetě klonovačů s vrahounem Jango Fetem, tak při pádu z budovy přehodí tenké ocelové lanko kolem sloupku a na tom se pak houpe. No, asi by přišel o všechny prsty...

[posloupnost] Když Padmé a Anakin společně snídají, Anakin rozkrojí hrušku a jeden kousek chce poslat Padmé. Když jí ho ale posílá, je kousek hrušky mnohem větší než ten, který ukrojil.

[posloupnost] Když Obi Wan Kenobi přichází na planetu Geonosis je tam tma, ale když slídí v takové obrovské hale, tak je tam vidět, jak se odráží světlo.

[chyby v animaci/efektech] Chyba se týká i předcházejícího dílu (SW:Skrytá hrozba). Kokpit Anakinova kluzáku je ve druhé epizodě použit ve scéně, kdy jsou Anakin a Padmé odváženi na popravu v jakémsi kočáru taženém jakýmsi zvířetem. V záběru z vrchní kamery(již v prostoru popraviště) lze lehce poznat, že kočár pro vězně je shodný s kokpitem závodního kluzáku z předcházejícího dílu, akorát bez fajnových nálepek.

[bez zařazení] Od epizody I. uběhlo deset let. Anakinův nevlastní bratr Ouwen je však rozhodně starší než devítiletý.

[bez zařazení] Představitelka Padmé má jinou barvu vlasů, než jsou její příčesky.

[bez zařazení] Tato chyba se týká všech dílů. Když je nějaký Jedi nebo Sith zabit, tak meč spadne na zem a hned se vypne. Neměl by však spadnout na zem a zářit dál?